双頭巨人戦は、ふたり一組のチーム同士で戦う多人数戦フォーマットです。各チームとも、個人単位ではなくチームとして各アクションを起こします。また、他の多人数戦フォーマットと異なるルールもあります。

• 各チームの最初のライフ総量は、ふたり共有で30点です。
• 各チームともふたり同時にターンを進行します。チームとしてドローを行い、チームとして攻撃やブロックを行うなど、すべてのフェイズをチーム単位で行います。
• 先攻チームは最初のターンにドローを行いません。
• ライフ以外のリソースをチーム内で共有することはできません――つまり、手札やマナを共有することはできません。すなわち、カードの効果で「あなた」と指定された場合はそのプレイヤー個人のことを指します。
• 情報や戦略をチーム内で共有することはできます。
• 初回のマリガンでは７枚引き直すことができます。以降はマリガン１回につき（６枚、５枚、４枚……と）１枚ずつ減っていきます。

ライフ総量が０以下になるか、毒カウンターを15個以上持つか、あるいはチームメンバーのいずれかがドローできなくなった場合、そのチームの敗北となります。ダメージを受けたりライフを失ったりという効果はプレイヤー個人が受けます。しかしその効果はチームの共有ライフに影響します。例えばブロック指定終了後、ブロックされなかった各クリーチャーはダメージを与えるプレイヤーを割り当てられます。その後与えられたダメージは合計され、その数字分チームのライフ総量が減ります。

「各対戦相手」や「各プレイヤー」を対象にした効果は、チームメンバーそれぞれに影響します。例えば、《狂暴な吸血者》が戦場に出たとき、各プレイヤーはそれぞれ２点のライフを失います――それぞれが２点失い、チームでは合計４点のライフを失うことになるのです。

双頭巨人構築戦においては、「チーム共同デッキ構築」のルールが適用されます。基本土地以外のカードはすべて、ふたつのデッキで合わせて４枚まで使用することができます。双頭巨人リミテッドにおいては、カード・プールをチームで共有します。開封したカードを合わせて、ともにふたり分のデッキを構築するのです。